目前，对许多常见的儿童疾病的临床治疗还存在着许多错误的观点。最近，美国儿科学会和美国疾病控制中心(CDC)公布了鉴别病毒感染和细菌感染的指南，并推荐了针对一些常见儿科疾病的治疗新思维。
用抗生素应有临床指征在儿科治疗新思维中，对抗生素的临床应用非常慎重。如对于耳道感染，当出现感染迹象时，2岁以下的儿童应立即进行治疗；但对于大于2岁的儿童，医生在处方抗生素前，应尽可能获得感染病因的准确临床证据。
一般来说，细菌感染的儿童耳道有渗液、发烧、疼痛、耳部发红等症状。出现全身感觉不舒服或有其他症状并不表明一定是细菌感染。如果难以确定感染类型，专家建议，医生应在对疼痛进行治疗的同时静候观察。
而对于剧烈的咽喉痛，CDC建议医生始终要进行喉咙提取物的链球菌培养检查，在结果没出来之前不能应用抗生素。支气管炎主要是由病毒引起的感染。对于支气管炎，CDC推荐应用抗生素的指标是怀疑有肺炎或咳嗽持续超过10至14天且没有改善。
医生指出，那些近期曾服用抗生素而今又被其他病原体感染的儿童，发生耐药感染的可能性是没有用抗生素者的三至九倍。